2-อะมิโน-6-คลอโรเบนโซไทอะโซลเป็นสารประกอบเฮเทโรไซคลิกที่ใช้เป็นสารตั้งต้นในงานสังเคราะห์อินทรีย์ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ใช้เป็นส่วนประกอบในการสังเคราะห์สารชีวภาพที่มีศักยภาพต้านจุลชีพและต้านการอักเสบ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ทำให้เหมาะสำหรับการผลิตสีย้อมและสารฟอกขาวเรืองแสงสำหรับสิ่งทอและกระดาษ อนุพันธ์ของสารนี้ถูกศึกษาสำหรับการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเพื่อสารป้องกันพืช นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารประกอบเบนโซไทอะโซลที่ซับซ้อนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย รวมถึงในงานวิจัยชีวเคมีสำหรับสารเรืองแสง