ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในยาที่มีโครงสร้างเป็นพายโรลิดีน ซึ่งพบได้บ่อยในกลุ่มยายับยั้งเอนไซม์หรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมิโนระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ช่วยให้ควบคุมทิศทางของปฏิกิริยาได้ดีขึ้น และลดการเกิดผลพลอยได้ที่ไม่ต้องการ หลังจากนั้นสามารถถอดหมู่ Boc ออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน เพื่อเปิดให้หมู่อะมิโนทำปฏิกิริยาต่อไปในขั้นตอนถัดไป จึงนิยมใช้ในสังเคราะห์สารต้นแบบ (lead compound) และการวิจัยพัฒนายาใหม่