ตัวกลางเมแทบอลิซึมกำมะถันคือสารประกอบที่เกี่ยวข้องกับการดูดซึมและรวมกำมะถันเข้าไปในชีวโมเลกุล เช่น กรดอะมิโน ในระบบชีวภาพ หมวดหมู่นี้รวมถึงสารเคมีที่ใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษากลไกกำมะถันในพืช จุลินทรีย์ และกระบวนการเซลล์