สารละลายกรดเตตราเฟลูออโรบอริกถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาอัลคิลเลชันและอะซิเลชัน มันทำหน้าที่เป็นแหล่งของไอออนเคาน์เตอร์ที่ไม่ใช่ nucleophile คือ BF4⁻ ทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาที่ต้องการความเป็นกรดเข้มข้นโดยปราศจากการแทรกแซงแบบ nucleophilic ถูกนำมาใช้ในการเตรียมเกลือไดโซเนียม ซึ่งเป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสีย้อมและเม็ดสี กรดนี้ยังถูกใช้ในกระบวนการชุบโลหะไฟฟ้า โดยเฉพาะสำหรับโลหะผสมอะลูมิเนียมและสังกะสี ซึ่งช่วยปรับปรุงความเสถียรของน้ำยาชุบและประสิทธิภาพการสะสมโลหะ ในอุตสาหกรรมการกลั่นปิโตรเลียม มันทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับการไอโซเมอร์ไรเซชันและอัลคิลเลชันของไฮโดรคาร์บอนเพื่อผลิตเชื้อเพลิงที่มีค่าออกเทนสูง นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในสารกัดกร่อนสำหรับเซมิคอนดักเตอร์และในการสังเคราะห์ของเหลวไอออนิกสำหรับการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมเฉพาะทาง เนื่องจากมีฤทธิ์เป็นกรดเข้มข้นและกัดกร่อนสูง จึงต้องใช้ด้วยความระมัดระวังและควบคุมสภาวะอย่างเคร่งครัด