Acridine Yellow G ใช้หลักๆ เป็นสีย้อมเรืองแสงในงานย้อมสีทางชีวภาพและจุลทรรศน์วิทยา มีประสิทธิภาพสูงในการเน้นโครงสร้างเซลล์ เช่น กรดนิวคลีอิก เนื่องจากมี affinity การจับกับ DNA และ RNA สูง สีย้อมนี้ถูกนำไปใช้อย่างแพร่หลายในจุลทรรศน์เรืองแสงเพื่อแสดงภาพและศึกษาองค์กรและพฤติกรรมของโครโมโซมระหว่างการแบ่งเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้ในฮิสโตโลยีสำหรับย้อมเนื้อเยื่อเพื่อแยกแยะส่วนประกอบเซลล์ภายใต้กล้องจุลทรรศน์ Acridine Yellow G ยังถูกนำไปใช้ใน flow cytometry ซึ่งช่วยในการวิเคราะห์และคัดแยกเซลล์ตามคุณสมบัติการเรืองแสง ความสามารถในการปล่อยแสงเรืองแสงสว่างภายใต้แสง UV ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่ามากในแอปพลิเคชันวินิจฉัยและวิจัยต่างๆ