DMT-Cl ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์ oligonucleotides โดยเฉพาะในสาขาชีววิทยาโมเลกุลและการวิจัยทางพันธุกรรม สารนี้ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับกลุ่มไฮดรอกซิล 5' ในระหว่างการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็งของ DNA และ RNA สารประกอบนี้ช่วยให้เกิดการถอดกลุ่มป้องกันอย่างเลือกสรร ซึ่งช่วยให้สามารถควบคุมการประกอบโซ่ของนิวคลีโอไทด์ได้อย่างแม่นยำ การประยุกต์ใช้ของ DMT-Cl มีความสำคัญอย่างยิ่งในการผลิต primers, probes และ oligonucleotides อื่นๆ ที่ใช้ใน PCR, การจัดลำดับลำดับ (sequencing) และเทคโนโลยีการตัดต่อยีน เช่น CRISPR นอกจากนี้ DMT-Cl ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมนิวคลีโอไทด์ที่ดัดแปลงสำหรับวัตถุประสงค์ทางบำบัดและวินิจฉัย สนับสนุนความก้าวหน้าในยาเฉพาะบุคคลและเทคโนโลยีชีวภาพ