Bis-propargyl-PEG12 ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางเคมีและชีววิทยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการเชื่อมโยงโมเลกุลผ่านปฏิกิริยา click chemistry ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการสร้างพันธะเคมีระหว่างโมเลกุลได้อย่างมีประสิทธิภาพและแม่นยำ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์วัสดุนาโนและพอลิเมอร์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน เพื่อนำไปใช้ในด้านการแพทย์ เช่น การส่งส่งยาแบบมุ่งเป้า (drug delivery) และการสร้างไฮโดรเจลสำหรับการรักษาบาดแผล นอกจากนี้ Bis-propargyl-PEG12 ยังมีความสำคัญในการพัฒนาชีววัสดุ (biomaterials) ที่มีความเข้ากันได้ทางชีวภาพสูง เพื่อใช้ในอุปกรณ์ทางการแพทย์และวิศวกรรมเนื้อเยื่อ