CI-966 hydrochloride ใช้ในการศึกษาทางวิทยาศาสตร์เกี่ยวกับระบบประสาท โดยเฉพาะในด้านการเรียนรู้และความจำ เนื่องจากเป็นสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบ GABAergic ซึ่งเกี่ยวข้องกับการควบคุมการส่งสัญญาณในสมอง นอกจากนี้ยังมีการศึกษาถึงศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาท เช่น โรควิตกกังวลและโรคซึมเศร้า อย่างไรก็ตาม การใช้งานยังอยู่ในขั้นตอนการวิจัยและพัฒนา ไม่ได้ใช้ในทางการแพทย์ทั่วไป