3-O-methyl-N-acetyl-D-Glucosamine (3-O-methyl-GlcNAc) ถูกนำมาใช้หลักๆ ในการวิจัยทางชีวเคมีและชีวการแพทย์ในฐานะเครื่องมือเฉพาะทางสำหรับศึกษากระบวนการไกลโคไซเลชัน (glycosylation) และการเมแทบอลิซึมของคาร์โบไฮเดรต โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือตัวยับยั้งในงานทดลองเอนไซม์เพื่อตรวจสอบกิจกรรมของไกลโคซิลทรานสเฟอเรส (glycosyltransferases) และไกลโคซิเดส (glycosidases) ซึ่งมีความสำคัญต่อการทำความเข้าใจการส่งสัญญาณในเซลล์และการปรับเปลี่ยนโปรตีน ในสาขาไกลโคไบโอโลจี (glycobiology) มันช่วยในการสำรวจบทบาททางโครงสร้างและหน้าที่ของไกลแคน (glycans) ในกระบวนการจดจำเซลล์ การตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน และปฏิสัมพันธ์กับพาธาเจน นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนายาและเครื่องมือวินิจฉัยที่基于ไกลแคน โดยเฉพาะในงานวิจัยมะเร็ง ซึ่งรูปแบบการไกลโคไซเลชันที่เปลี่ยนแปลงเป็นลักษณะเด่นของการดำเนินโรค ความโครงสร้างที่มีการเมทิลที่ตำแหน่ง 3 ทำให้มีคุณค่าต่อเคมีสังเคราะห์ในการออกแบบและสังเคราะห์ไกลโคคอนจูเกต (glycoconjugates) ใหม่ๆ