ท็อบรามัยซิน ซัลเฟต ใช้เป็นยาปฏิชีวนะในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียในร่างกาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งการติดเชื้อในระบบทางเดินหายใจ เช่น โรคซิสติก ไฟโบรซิส (Cystic Fibrosis) ที่มักเกิดการติดเชื้อในปอด นอกจากนี้ยังใช้ในการรักษาการติดเชื้อในดวงตา เช่น โรคเยื่อบุตาอักเสบ (Conjunctivitis) และแผลติดเชื้อที่กระจกตา (Corneal Ulcer) โดยมักใช้ในรูปแบบยาหยอดตา หรือยาขี้ผึ้งทาตา ในบางกรณีอาจใช้ในรูปแบบยาฉีดสำหรับการติดเชื้อรุนแรงในระบบอื่น ๆ ของร่างกาย เช่น ระบบทางเดินปัสสาวะหรือผิวหนัง