ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารกลางทางเภสัชกรรมและของเหลวไอออนิก การรวมตัวกันอย่างไม่เหมือนใครของส่วนที่เป็นขั้วและส่วนฟลูออรีนทำให้เหมาะสำหรับปฏิกิริยาคะตะไลติกที่ต้องการการควบคุมการละลายและการคงตัวของสารกลางที่มีประจุ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมตัวทำละลายพิเศษสำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์ เนื่องจากส่วน trifluoroacetate มีความเข้ากันได้กับชีวโมเลกุลที่อ่อนไหว นอกจากนี้ยังใช้ในงานไฟฟ้าเคมีเป็นส่วนประกอบในระบบอิเล็กโทรไลต์ที่ซึ่งความเสถียรทางความร้อนและการนำไอออนิกมีความสำคัญ