ซิเมลากาทรานถูกใช้หลักๆ เป็นยาต้านการแข็งตัวของเลือดเพื่อป้องกันและรักษาการเกิดลิ่มเลือด โดยมีประสิทธิภาพสูงในการลดความเสี่ยงของภาวะหลอดเลือดสมองอุดตันในผู้ป่วยที่มีภาวะหัวใจห้องบนสั่น (atrial fibrillation) ซึ่งเป็นภาวะที่หัวใจเต้นผิดจังหวะ นอกจากนี้ ยังใช้ในการป้องกันภาวะลิ่มเลือดอุดตันในหลอดเลือดดำ (venous thromboembolism) ในผู้ป่วยที่ได้รับการผ่าตัดกระดูก เช่น การเปลี่ยนข้อสะโพกหรือข้อเข่า ยานี้ทำงานโดยยับยั้งธรมบิน (thrombin) ซึ่งเป็นเอนไซม์สำคัญในกระบวนการแข็งตัวของเลือดโดยตรง เพื่อป้องกันการเกิดลิ่มเลือด การให้ยาทางปากทำให้สะดวกกว่ายาต้านการแข็งตัวแบบดั้งเดิม เช่น วาร์ฟาริน ซึ่งต้องมีการตรวจติดตามบ่อยครั้ง อย่างไรก็ตาม การใช้ยานี้ถูกจำกัดเนื่องจากความเสี่ยงต่อตับ และไม่มีการวางจำหน่ายอย่างแพร่หลายในหลายประเทศ