ไบโอติน-PEG3-MAL ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการเชื่อมโยงทางชีวภาพ (bioconjugation) และการวิจัยทางชีวเคมี โดยทำหน้าที่เป็นตัวเชื่อมเพื่อติดไบโอตินเข้ากับโปรตีน เพปไทด์ หรือโมเลกุลอื่นๆ ทำให้สามารถตรวจจับหรือทำให้บริสุทธิ์ได้ผ่านปฏิกิริยาสเตรปตาวิดิน-ไบโอติน พื้นที่ห่าง PEG3 ช่วยเพิ่มความละลายและลดการขัดขวางทาง steric ซึ่งช่วยปรับปรุงประสิทธิภาพการจับคู่นี้ สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการทดสอบอิมมูโนแอสเซย์ การติดฉลากด้วยฟลูออเรสเซนส์ และระบบนำส่งยาแบบกำหนดเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังช่วยในการศึกษาปฏิสัมพันธ์โปรตีน-โปรตีนและกระบวนการเซลล์โดยอำนวยความสะดวกในการติดไบโอตินylated โพรบเข้ากับไบโอโมเลกุล กลุ่มมาไลอิไมด์ของมันช่วยให้สามารถคอนจูเกตเฉพาะเจาะจงกับสารประกอบที่มีกลุ่มไทออล ทำให้เกิดการปรับเปลี่ยนที่แม่นยำและเสถียร