ใช้เป็นสารตัวกลางหลักในปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามของซูซูกิ-มิยาวาระในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร หมู่เอสเตอร์บอโรเนตช่วยให้เกิดการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยเฉพาะในการพัฒนาแซนโทละคริพีรีดีนที่ถูกแทนที่ด้วยไตรฟลูออโรเมทิล ซึ่งเป็นโครงสร้างที่พบบ่อยในโมเลกุลชีวภาพที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีเภสัชกรรมในการสร้างยาตัวสมุครสำหรับโรคระบบประสาทส่วนกลาง การอักเสบ และโรคเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารตัวกลางขั้นสูงสำหรับสารป้องกันพืช เนื่องจากหมู่ไตรฟลูออโรเมทิลให้ความเสถียรและลิโพฟิลิก