ไฮดรอกซีโพรพิลไคโตซานถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในสาขาการแพทย์ชีวภาพเนื่องจากความเข้ากันได้ทางชีวภาพและการย่อยสลายได้ทางชีวภาพ มักใช้ในการรักษาบาดแผลเพราะช่วยส่งเสริมการการฟื้นฟูเนื้อเยื่อและมีคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ ในระบบการส่งยา ทำหน้าที่เป็นตัวพาหะสำหรับการปล่อยยาแบบควบคุม เพิ่มความเสถียรและประสิทธิภาพของยา สารเคมีนี้ยังถูกใช้ในเครื่องสำอาง โดยเฉพาะผลิตภัณฑ์ดูแลผิว สำหรับคุณสมบัติให้ความชุ่มชื้นและการสร้างฟิล์ม นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในเกษตรกรรมเป็นสารเคลือบเมล็ดเพื่อปรับปรุงการงอกและการเจริญเติบโตของพืช ความสามารถในการสร้างเจลทำให้เหมาะสำหรับใช้ในบรรจุภัณฑ์อาหารเพื่อยืดอายุการเก็บรักษาโดยทำหน้าที่เป็นตัวกั้นความชื้นและก๊าซ