3,3prime-Diheptyloxacarbocyanine iodide ถูกใช้อย่างแพร่หลายในด้านวิทยาศาสตร์ชีวภาพและเทคโนโลยีชีวภาพ โดยเฉพาะในกระบวนการติดตามและศึกษาการเคลื่อนไหวของเซลล์และโมเลกุลภายในเซลล์ เนื่องจากคุณสมบัติการเรืองแสงที่โดดเด่นของสารนี้ ทำให้มันเป็นเครื่องมือสำคัญในการทำเครื่องหมายเซลล์ (cell labeling) และการถ่ายภาพเซลล์ (cell imaging) โดยเฉพาะในเทคนิคเช่น fluorescence microscopy และ flow cytometry

นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษากระบวนการทางชีวเคมีต่างๆ เช่น การติดตามการเปลี่ยนแปลงของเมมเบรนเซลล์ การวัดศักย์ไฟฟ้าของเซลล์ และการวิเคราะห์การมีปฏิสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุลภายในเซลล์ ด้วยความสามารถในการแทรกซึมเข้าไปในโครงสร้างของเซลล์ได้ดี ทำให้สารนี้มีประโยชน์ในการวิจัยทางด้านชีววิทยาโมเลกุลและเซลล์

อีกทั้ง 3,3prime-Diheptyloxacarbocyanine iodide ยังถูกใช้ในการพัฒนาวิธีการวินิจฉัยโรคและการทดสอบทางคลินิก โดยเฉพาะในกระบวนการที่เกี่ยวข้องกับการตรวจจับเซลล์ผิดปกติหรือเซลล์มะเร็ง ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการวิเคราะห์และวินิจฉัยโรคได้อย่างแม่นยำมากขึ้น