DiOC16(3) perchlorate ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสีย้อมเรืองแสงในการวิจัยทางชีววิทยา โดยเฉพาะสำหรับการศึกษาเยื่อหุ้มเซลล์และพลวัตของลิพิด สารนี้มีประสิทธิภาพสูงในการติดฉลากและแสดงภาพเซลล์ที่มีชีวิต เนื่องจากความสามารถในการรวมตัวเข้ากับชั้นลิพิดสองชั้น สีย้อมนี้มักใช้ในกล้องจุลทรรศน์เรืองแสงเพื่อติดตามศักย์เยื่อหุ้มเซลล์และตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างของเซลล์ นอกจากนี้ ยังใช้ใน flow cytometry เพื่อวิเคราะห์ประชากรเซลล์ตามคุณสมบัติของเยื่อหุ้มเซลล์ คุณสมบัติลิโพฟิลิกทำให้เหมาะสำหรับการตรวจสอบความไหลของเยื่อหุ้มเซลล์และการจัดระเบียบในเซลล์ประเภทต่างๆ นักวิจัยยังใช้ในการศึกษา vesicle trafficking และกระบวนการหลอมเยื่อหุ้มเซลล์ในระบบเซลล์