AMPHOLINE ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการอิเล็กโตรโฟรีซิสแบบไอโซอิเล็กทริกโฟกัส (IEF) สำหรับการแยกและวิเคราะห์โปรตีนตามจุดไอโซอิเล็กทริก (pI) ของพวกมัน เนื่องจาก AMPHOLINE สามารถสร้างช่วง pH ที่เสถียรและต่อเนื่อง ทำให้สามารถแยกโปรตีนที่มีค่า pI ใกล้เคียงกันได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการศึกษาความหลากหลายของโปรตีนในตัวอย่างทางชีววิทยา เช่น เลือดหรือเนื้อเยื่อ เพื่อช่วยในการระบุและวิเคราะห์โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับโรคหรือภาวะทางสุขภาพต่าง ๆ อีกทั้งยังมีบทบาทสำคัญในงานวิจัยทางชีวเคมีและอณูชีววิทยา เพื่อทำความเข้าใจโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีนในระดับลึกยิ่งขึ้น