เอนไซม์อัลดีไฮด์ดีไฮโดรจีเนส มีบทบาทสำคัญในการทำลายแอลกอฮอล์ในร่างกาย โดยเฉพาะการเปลี่ยนอะซีทัลดีไฮด์ ซึ่งเป็นสารพิษที่เกิดจากการเมแทบอลิซึมของแอลกอฮอล์ ให้กลายเป็นกรดอะซีติกที่ไม่เป็นอันตราย ทำให้ช่วยลดอาการเป็นพิษจากแอลกอฮอล์ เช่น ปวดหัว คลื่นไส้ หรือหน้าแดงหลังดื่มแอลกอฮอล์ นอกจากนี้ เอนไซม์นี้ยังมีความสำคัญในกระบวนการบำบัดรักษาผู้ติดแอลกอฮอล์ โดยการพัฒนายาที่ยับยั้งการทำงานของเอนไซม์นี้ทำให้เกิดผลข้างเคียงเมื่อดื่มแอลกอฮอล์ จึงช่วยให้ผู้ป่วยเลิกดื่มได้ ในงานวิจัยทางการแพทย์ เอนไซม์นี้ยังถูกใช้เป็นตัวบ่งชี้ชีวภาพ (biomarker) ในการศึกษาเซลล์ต้นกำเนิด โดยเฉพาะเซลล์ต้นกำเนิดของระบบประสาทและเซลล์ต้นกำเนิดมะเร็ง เนื่องจากเซลล์เหล่านี้มักมีระดับของเอนไซม์นี้สูงกว่าปกติ ในอุตสาหกรรมชีวภาพ เอนไซม์นี้ถูกนำไปใช้ในการตรวจวัดระดับอะซีทัลดีไฮด์ในตัวอย่างชีวภาพ หรือในระบบเซนเซอร์ชีวภาพเพื่อตรวจสอบคุณภาพของอาหารและเครื่องดื่มที่มีการหมัก