ทรานส์กลูตามิเนสเป็นเอนไซม์ที่ใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมอาหารเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติของโปรตีน โดยเฉพาะในกระบวนการเชื่อมโยงโปรตีนให้มีความเหนียวและยืดหยุ่นมากขึ้น มักใช้ในการผลิตผลิตภัณฑ์เนื้อสัตว์แปรรูป เช่น ไส้กรอก แฮม และเนื้อบด ช่วยให้เนื้อมีเนื้อสัมผัสที่ดีขึ้นและคงรูปได้ดี นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมผลิตภัณฑ์นม เช่น เนยแข็ง เพื่อปรับปรุงเนื้อสัมผัสและเพิ่มความหนาแน่นของผลิตภัณฑ์ ในอุตสาหกรรมขนมอบ ทรานส์กลูตามิเนสช่วยให้แป้งมีความเหนียวและยืดหยุ่นมากขึ้น ช่วยให้ขนมอบมีโครงสร้างที่ดีขึ้นและคงรูปได้นานขึ้น