SU5408 ถูกใช้เป็นหลักในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะตัวยับยั้งที่แรงต่อ tyrosine kinases ของตัวรับ fibroblast growth factor receptor (FGFR) และ vascular endothelial growth factor receptor (VEGFR). มันถูกใช้อย่างแพร่หลายในการศึกษาบทบาทของตัวรับเหล่านี้ในการส่งสัญญาณเซลล์ การเกิดหลอดเลือดใหม่ (angiogenesis) และการเจริญเติบโตของเนื้องอก นักวิจัยใช้ SU5408 เพื่อยับยั้งกิจกรรมของ FGFR และ VEGFR ช่วยให้เข้าใจบทบาทของพวกมันในการลุกลามของมะเร็งและโรคอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับการเพิ่มจำนวนเซลล์ผิดปกติ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในชีววิทยาการพัฒนาเพื่อศึกษาผลกระทบของการส่งสัญญาณ FGFR ต่อการพัฒนา embryo และการ再生เนื้อเยื่อ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการทดลอง in vitro และ in vivo ให้ข้อมูลเชิงลึกสู่เป้าหมายบำบัดที่เป็นไปได้สำหรับมะเร็งและภาวะอื่นๆ