5-IAF (5-Iodoacetamidofluorescein) ใช้ในการติดฉลากโมเลกุลทางชีวภาพเพื่อการศึกษาด้วยเทคนิคทางแสง เช่น การติดตามการเคลื่อนที่ของโปรตีนหรือเซลล์ในระบบชีวภาพ เนื่องจากมีคุณสมบัติเรืองแสงที่สามารถตรวจจับได้ง่าย นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาทางเคมีของโปรตีน โดยเฉพาะการติดฉลากที่กลุ่มซัลไฮดริล (thiol groups) ซึ่งช่วยให้นักวิจัยสามารถสังเกตและวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของโมเลกุลได้อย่างแม่นยำ