Benzyl-PEG8-Ots ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารเคมีในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการปรับเปลี่ยนไบโอโมเลกุล การใช้งานหลักอยู่ในสาขาการไบโอคอนจูเกชัน ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารเชื่อมโยงเพื่อติดโซ่ polyethylene glycol (PEG) กับสารตั้งต้นต่างๆ เช่น โปรตีน เพปไทด์ หรือโมเลกุลขนาดเล็ก กระบวนการนี้ที่เรียกว่า PEGylation ช่วยเพิ่มความละลาย ความเสถียร และ bioavailability ของโมเลกุลที่ถูกคอนจูเกต ทำให้มีคุณค่าในระบบการส่งยาและสูตรยารักษา นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนาโปรดรักและการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมาย ซึ่งต้องการการปลดปล่อยที่ควบคุมหรือการส่งที่เฉพาะเจาะจง กลุ่มเบนซิลให้หน้าที่ป้องกัน ซึ่งสามารถถูกกำจัดออกภายใต้สภาวะเฉพาะ ทำให้สามารถปรับเปลี่ยนทางเคมีได้อย่างแม่นยำ สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการฟังก์ชันนาไลเซชันพื้นผิวและในการสร้างวัสดุพอลิเมอร์ขั้นสูง