Acid-PEG3-PFP ester ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการไบโอคอนจูเกชันและเคมีชีวภาพสำหรับการปรับเปลี่ยนชีวโมเลกุล กลุ่มเอสเตอร์ PFP ที่ทำปฏิกิริยาได้ช่วยให้การจับคู่กับอะมีนมีประสิทธิภาพ ทำให้มีคุณค่าต่อการติดฉลากโปรตีน เปปไทด์ และแอนติบอดี สารประกอบนี้มีประโยชน์เป็นพิเศษในการพัฒนาระบบการส่งยา ซึ่งช่วยในการติดตั้งลิแกนด์เป้าหมายหรือตัวแทนบำบัดกับพาหะ นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการสังเคราะห์โพลิเมอร์และวัสดุที่ถูกปรับแต่งหน้าที่สำหรับการใช้งานทางการแพทย์ชีวภาพ เช่น ไฮโดรเจลหรือนาโนอนุภาค ช่องว่าง PEG ของมันช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและลดการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน ทำให้เหมาะสมสำหรับการใช้งานในร่างกาย นักวิจัยยังใช้ในการเตรียมไบโอคอนจูเกตสำหรับการถ่ายภาพวินิจฉัยและการศึกษาทางบำบัด