ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบอินทรีย์ฟลูออรีน หมู่โบรมีนและฟลูออรีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาครอสคัปเปลิงแบบเลือก性ได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการค้นพบยา ใช้บ่อยในปฏิกิริยาที่มีตัวเร่งพาลลาเดียม เช่น Suzuki หรือ Heck couplings เพื่อนำโครงสร้าง difluoromethoxybenzene เข้าสู่โครงสร้างเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ โดยที่อะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์