Ciproxifan maleate ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยเพื่อศึกษาบทบาทของตัวรับฮิสตามีน H3 ในระบบประสาทส่วนกลาง โดยทำหน้าที่เป็นตัวแอนตากอนิสม์ที่แรงและเลือกสรรต่อตัวรับเหล่านี้ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการตรวจสอบหน้าที่ของตัวรับในกระบวนการทางสรีรวิทยาต่างๆ นักวิจัยใช้สารนี้เพื่อสำรวจผลกระทบที่เป็นไปได้ต่อหน้าที่การรับรู้ เช่น ความจำและการเรียนรู้ รวมถึงผลกระทบต่อวงจรการนอน-ตื่นและความสนใจ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาสำหรับการประยุกต์ใช้ทางบำบัดที่เป็นไปได้ในความผิดปกติทางระบบประสาท เช่น โรคหลับใน (narcolepsy), ADHD และโรคอัลไซเมอร์ เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนกิจกรรมฮิสตามีนในสมอง การประยุกต์ใช้ของสารนี้จำกัดอยู่ที่การศึกษาก่อนคลินิกเป็นหลัก ซึ่งมีส่วนช่วยในการทำความเข้าใจกลไกตัวรับฮิสตามีนให้ลึกซึ้งยิ่งขึ้น