สารละลายแอมโมเนียมอะซีเตตใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีเป็นบัฟเฟอร์ในวิเคราะห์ HPLC และ LC-MS เพื่อให้สภาวะ pH คงที่สำหรับการแยกและตรวจจับสารประกอบอย่างแม่นยำ ทำหน้าที่เป็นแหล่งกำเนิดแอมโมเนียในการสังเคราะห์อินทรีย์ สนับสนุนปฏิกิริยาเช่นการเตรียมอะเซทาไมด์ ในชีววิทยาโมเลกุล ใช้ในการตกตะกอน DNA และ RNA เนื่องจากความสามารถในการทำให้ประจุบนกรดนิวคลีอิกเป็นกลาง ช่วยในการแยกต่างหาก นอกจากนี้ ทำหน้าที่เป็นตัวปรับปรุงเฟสเคลื่อนที่ในโครมาโตกราฟี ปรับปรุงการแยกสารประกอบขั้ว และการใช้ในผลึกโปรตีนช่วยรักษาความเสถียรของโปรตีนระหว่างกระบวนการตกผลึก