บรอมครีซอลกรีนใช้อย่างแพร่หลายเป็นตัวบ่งชี้ pH ในงานวิเคราะห์และการทดลองในห้องปฏิบัติการต่างๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการทดลองไทเทรตเพื่อกำหนดจุดสิ้นสุดของปฏิกิริยากรด-เบส เนื่องจากมันเปลี่ยนสีในช่วง pH 3.8 ถึง 5.4 จากสีเหลืองในสภาวะกรดเป็นสีน้ำเงินในสภาวะด่าง

ในทางจุลชีววิทยา ใช้ในอาหารเลี้ยงเชื้อเพื่อตรวจสอบการเปลี่ยนแปลง pH เพื่อให้มั่นใจในสภาวะการเจริญเติบโตที่เหมาะสมสำหรับจุลินทรีย์ นอกจากนี้ ยังใช้ในทางชีวเคมีสำหรับการแยกโปรตีนด้วยไฟฟ้า (protein electrophoresis) เพื่อแสดงภาพพิมพ์เขียวของการไล่ระดับสี pH และประเมินความคืบหน้าของกระบวนการแยก ความสามารถในการให้สัญญาณภาพที่ชัดเจนทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าทั้งในการวิเคราะห์เชิงคุณภาพและเชิงปริมาณ