N-Propargylmaleimide ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านเคมีคลิก (click chemistry) โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีความซับซ้อน เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันที่สามารถทำปฏิกิริยาได้รวดเร็วและมีประสิทธิภาพ เช่น กลุ่ม alkyne ที่สามารถทำปฏิกิริยา cycloaddition กับ azides ได้ง่าย กระบวนการนี้เรียกว่า CuAAC (Copper-Catalyzed Azide-Alkyne Cycloaddition) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมใช้ในการเชื่อมต่อโมเลกุลขนาดเล็กเข้าด้วยกันเพื่อสร้างโมเลกุลที่ใหญ่ขึ้นหรือโครงสร้างที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการปรับเปลี่ยนโปรตีนและเปปไทด์ เพื่อศึกษาปฏิสัมพันธ์ทางชีวภาพและกลไกการทำงานของโมเลกุลเหล่านี้ รวมถึงการพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น เนื่องจากสามารถเชื่อมต่อกับโมเลกุลชีวภาพได้อย่างแม่นยำและเฉพาะเจาะจง ในด้านวัสดุศาสตร์ N-Propargylmaleimide ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์โพลีเมอร์และวัสดุนาโนที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น ความทนทาน ความยืดหยุ่น และความสามารถในการตอบสนองต่อสิ่งแวดล้อม ซึ่งสามารถนำไปประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมต่างๆ ได้อย่างหลากหลาย