Lipoamide-PEG3-Mal ใช้ในการวิจัยทางชีววิทยาและเคมี โดยเฉพาะในการปรับเปลี่ยนและเชื่อมโยงโมเลกุลทางชีวภาพ เช่น โปรตีนและเปปไทด์ เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันที่มีปฏิกิริยาสูง ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะโควาเลนต์กับโมเลกุลเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาระบบนำส่งยาและวัสดุนาโนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการดูดซึมและความเสถียรของยาในร่างกาย การประยุกต์ใช้ในด้านชีวการแพทย์ เช่น การสร้างสารประกอบสำหรับการวินิจฉัยโรคและการรักษาแบบเฉพาะเจาะจงก็เป็นอีกหนึ่งบทบาทสำคัญของสารนี้