ใช้เป็นสารบัฟเฟอร์ในเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะใน electrophoresis และ chromatography เพื่อช่วยรักษาสภาวะ pH ให้คงที่ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมอนุพันธ์กรดมาลอนิกที่ใช้ในเภสัชกรรมและสารเคมีเกษตร ในบางกรณี ถูกนำไปใช้ในอ่าง electroplating เพื่อปรับปรุงความสม่ำเสมอของการสะสมโลหะ นอกจากนี้ โพแทสเซียมมาลอเนตยังถูกนำไปใช้ในงานวิจัยชีวเคมีสำหรับการศึกษา inhibition ของเอนไซม์ เนื่องจากสารมาลอเนตสามารถทำหน้าที่เป็น competitive inhibitor ของ succinate dehydrogenase ซึ่งเกี่ยวข้องกับกระบวนการเมแทบอลิซึมในวงจร Krebs ยังสามารถใช้ควบคุม pH ในสภาวะเบสอ่อนที่มีความเสถียร เหมาะสำหรับระบบชีวภาพและการเตรียมสารละลายสำหรับการวิเคราะห์