เบอร์เบอรีน คลอไรด์ ไฮเดรต ถูกใช้ในอุตสาหกรรมยาและผลิตภัณฑ์สุขภาพเป็นหลัก โดยเฉพาะในผลิตภัณฑ์เสริมอาหารเพื่อช่วยควบคุมระดับน้ำตาลในเลือด ซึ่งเหมาะสำหรับผู้ที่มีภาวะน้ำตาลในเลือดสูงหรือโรคเบาหวานชนิดที่ 2 นอกจากนี้ยังมีการนำมาใช้เพื่อช่วยลดระดับคอเลสเตอรอลและไตรกลีเซอไรด์ในเลือด จึงนิยมใช้ในผู้ที่มีปัญหาไขมันในเลือดสูง สารนี้ยังมีคุณสมบัติต้านการอักเสบและต้านเชื้อแบคทีเรีย ทำให้บางครั้งถูกใช้ในผลิตภัณฑ์สำหรับรักษาอาการติดเชื้อในระบบทางเดินอาหาร เช่น ท้องร่วงจากแบคทีเรีย รวมถึงมีงานวิจัยที่ศึกษาบทบาทในการช่วยลดน้ำหนัก โดยเชื่อว่าช่วยเพิ่มการเผาผลาญและปรับสมดุลไมโครไบโอตาในลำไส้ ในด้านเครื่องสำอาง บางสูตรอาจใช้เบอร์เบอรีนในผลิตภัณฑ์ดูแลผิวที่มีสิว เนื่องจากมีฤทธิ์ต้านเชื้อและลดการอักเสบของผิวหนัง