Deoxypseudouridine ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการวิจัยกรดนิวคลีอิกและการพัฒนายา therapeutic โดยทำหน้าที่เป็น nucleoside ที่ถูกปรับเปลี่ยน ซึ่งมักถูกนำเข้าไปรวมใน oligonucleotides เพื่อเพิ่มความเสถียรและการทำงาน การปรับเปลี่ยนนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการออกแบบ antisense oligonucleotides และ small interfering RNAs (siRNAs) โดยช่วยเพิ่มความต้านทานต่อ nucleases ทำให้เพิ่มอายุการใช้งานและประสิทธิภาพของโมเลกุลเหล่านี้ในระบบชีวภาพ นอกจากนี้ Deoxypseudouridine ยังถูกสำรวจในการพัฒนายาใหม่ๆ รวมถึงการรักษาที่มีศักยภาพสำหรับโรคทางพันธุกรรมและการติดเชื้อไวรัส เนื่องจากความสามารถในการปรับการโต้ตอบของ RNA และกระบวนการประมวลผล คุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ทำให้เป็นผู้สมัครที่น่าจะเป็นไปได้สำหรับการพัฒนา gene therapy และ RNA-based therapeutics