สารนี้ถูกใช้ในการสังเคราะห์ oligonucleotides ซึ่งเป็นกระบวนการสำคัญในด้านชีวเคมีและพันธุวิศวกรรม โดยเฉพาะในการสร้างสาย DNA หรือ RNA ที่มีความจำเพาะสูง 3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyadenosine ทำหน้าที่เป็นสารป้องกันกลุ่ม hydroxyl ที่ตำแหน่ง 3' ของน้ำตาล deoxyribose ในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ ซึ่งช่วยให้สามารถควบคุมและปรับแต่งลำดับเบสได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเกี่ยวกับยีนและการพัฒนายาที่เกี่ยวข้องกับกรดนิวคลีอิกอีกด้วย