5'-O-DMT-2'-O-methyl-5-methyluridine ถูกใช้หลักๆ ในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นบล็อกสร้างนิวคลีโอไซด์ที่ได้รับการป้องกัน มีบทบาทสำคัญในการผลิตโมเลกุล RNA ที่ปรับเปลี่ยน โดยเฉพาะในการพัฒนาแอนติเซนส์โอลิโกนิวคลีโอไทด์และยา siRNA เทอราพิวติกส์ กลุ่ม DMT (dimethoxytrityl) ปกป้องกลุ่ม 5'-hydroxyl ระหว่างการสังเคราะห์ ในขณะที่การปรับเปลี่ยน 2'-O-methyl เพิ่มความเสถียรและความต้านทานต่อการย่อยสลายโดยเอนไซม์ nuclease ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างยาที่ใช้ฐาน RNA สำหรับเล็งเป้าไปที่โรคทางพันธุกรรม การติดเชื้อไวรัส และมะเร็ง การประยุกต์ใช้ยังมีความสำคัญในงานวิจัยสำหรับศึกษาคุณสมบัติโครงสร้าง หน้าที่ และปฏิสัมพันธ์ของ RNA