ไซทิดีน 5'-โมโนฟอสเฟต ดิโซเดียมซอลท์ ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในด้านชีวเคมีและเภสัชวิทยา โดยใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์นิวคลีโอไทด์และกรดนิวคลีอิก ซึ่งมีความสำคัญในการศึกษากระบวนการทางพันธุกรรมและการแสดงออกของยีน นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการผลิตยาและเวชภัณฑ์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในยาที่เกี่ยวข้องกับการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทและภูมิคุ้มกัน เนื่องจากมีบทบาทในการส่งเสริมการทำงานของเซลล์และการซ่อมแซมเนื้อเยื่อ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในอาหารเสริมเพื่อช่วยในการบำรุงสุขภาพและเพิ่มประสิทธิภาพของระบบเมตาบอลิซึมในร่างกาย