ไซโลซูโครสถูกนำมาใช้ในอุตสาหกรรมอาหารและเครื่องดื่มเป็นส่วนผสมที่ให้ความหวานและเป็นสารเพิ่มความหนืด โดยมักใช้ในผลิตภัณฑ์ที่ต้องการลดปริมาณน้ำตาลแต่ยังคงรสชาติที่ใกล้เคียงกับน้ำตาลธรรมชาติ นอกจากนี้ยังมีบทบาทในผลิตภัณฑ์สุขภาพและอาหารเสริมเนื่องจากมีคุณสมบัติเป็นพรีไบโอติก ช่วยส่งเสริมการเจริญเติบโตของแบคทีเรียที่ดีในลำไส้ ทำให้ระบบย่อยอาหารทำงานได้ดีขึ้น นอกจากนี้ยังมีการศึกษานำไซโลซูโครสไปใช้ในอุตสาหกรรมยาเพื่อพัฒนายาและสารเคลือบที่ช่วยในการปลดปล่อยตัวยาในร่างกายอย่างมีประสิทธิภาพ