สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในเคมีเปปไทด์ ซึ่งทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ทำหน้าที่เป็นสารป้องกันสำหรับกลุ่มฟังก์ชันอะมิโน ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกเฉพาะที่ตำแหน่งอื่นของโมเลกุลได้โดยไม่ถูกรบกวน โครงสร้าง hex-5-enoic acid ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในการสังเคราะห์เปปไทด์และ peptidomimetics นอกจากนี้ กลุ่มอัลคีนของมันให้จุดปฏิกิริยาที่ใช้งานได้สำหรับการฟังก์ชันนัไลเซชันเพิ่มเติม เช่น ผ่านปฏิกิริยา olefin metathesis หรือ hydrofunctionalization ซึ่งช่วยให้สร้างสถาปัตยกรรมโมเลกุลที่หลากหลาย สารประกอบนี้มีคุณค่าต่อการค้นคว้าและพัฒนายา ซึ่งการควบคุมโครงสร้างโมเลกุลอย่างแม่นยำเป็นสิ่งสำคัญ