Fmoc-1,2-trans-achc-oh ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะกลุ่มป้องกันสำหรับกรดอะมิโน กลุ่ม Fmoc มีคุณค่าด้วยความเสถียรภายใต้สภาวะเบสและความง่ายในการกำจัดภายใต้สภาวะอ่อนโยน ทำให้เหมาะสมสำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) สารประกอบนี้มักถูกนำมาใช้เพื่อนำข้อจำกัดทางคอนฟอร์เมชันเฉพาะเจาะจงเข้าสู่เปปไทด์ ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรและกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนา peptidomimetics ซึ่งเป็นสารประกอบที่เลียนแบบโครงสร้างและหน้าที่ของเปปไทด์แต่มีคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่ดีขึ้น Fmoc-1,2-trans-achc-oh ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบวงแหวน ซึ่งมีความสำคัญในกระบวนการค้นพบยาเนื่องจากมี affinity การจับและ selectivity ที่สูงขึ้น การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการเตรียมวัสดุฐานเปปไทด์และ bioconjugates ซึ่งถูกนำไปใช้ในแอปพลิเคชันชีวการแพทย์และเทคโนโลยีชีวภาพต่างๆ