Fmoc-L-Tryptophanol ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตาย (SPPS) โดยทำหน้าที่เป็นรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของ L-tryptophanol ซึ่งกลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับกลุ่มอะมีน สิ่งนี้ช่วยให้สามารถสร้างเปปไทด์แบบทีละขั้นตอนด้วยความแม่นยำและประสิทธิภาพสูง สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีนที่รวมเอาส่วนของ tryptophanol ซึ่งมีวงแหวนอินโดลคล้ายกับทริปโตเฟน การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการพัฒนายา เปปไทด์ชีวภาพ และเครื่องมือวิจัยในชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล นอกจากนี้ Fmoc-L-Tryptophanol ยังถูกใช้ในการเตรียมไลบรารีเปปไทด์สำหรับการค้นพบและคัดกรองยา