3,4,5,6-เตตระไฮโดร-2-ไพริมิดีนไทออล ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญสำหรับการผลิตยาเภสัชกรรมต่างๆ กลุ่มไทออลของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าสำหรับการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังภาวะเช่น ความดันโลหิตสูง มะเร็ง และการติดเชื้อแบคทีเรีย นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งจำเป็นในสารเคมีเกษตรสำหรับการป้องกันพืช การตอบสนองของสารนี้ยังเหมาะสำหรับการประยุกต์ใช้ในการวิจัย โดยเฉพาะในการศึกษาของโมเลกุลที่มีกำมะถันและกิจกรรมทางชีวภาพของ它们