ใช้เป็นสารตัวกลางหลักในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสและยาต้านไวรัส โครงสร้างไพริมิดีนที่ถูกฮาโลเจนแทนที่ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาครอส-คัปพลิงแบบเลือกเฉพาะ ซึ่งช่วยในการนำระบบอะโรมาติกฟลูออรีนเข้าไปในยาตัวสมัครรับ ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาเพื่อศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เนื่องจากผลดึงอิเล็กตรอนของฟลูออรีนและความตอบสนองของกลุ่มบรอม นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรและวัสดุฟังก์ชันนัลที่ซึ่งเฮเทอโรไซเคิลฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรและชีวเภสัชจลนศาสตร์