ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังโรคต่าง ๆ รวมถึงมะเร็งและโรคติดเชื้อ กลุ่มโบรอนิกแอซิดที่ตำแหน่ง 5 ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาคัพปลิงข้ามได้อย่างมีประสิทธิภาพ เช่น ปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura เพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ซึ่งสำคัญในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ กลุ่มคลอโรที่ตำแหน่ง 4 สนับสนุนปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอฟิลิกอะโรมาติก (SNAr) ทำให้สามารถนำเข้าสารนิวคลีโอไฟล์ที่หลากหลายได้อย่างเลือกสรร แกนไพรีมีดีนเป็นโครงสร้างย่อยทั่วไปในเคมียารักษา มักรวมเข้าในโมเลกุลที่มีศักยภาพในการบำบัด นอกจากนี้ กลุ่มไซโคลโพรพิลที่ตำแหน่ง 2 สามารถเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับของยาที่เป็นผู้สมัครสุดท้าย