เอนโดนิวคลีเอส SbfI ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางด้านพันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพ โดยเฉพาะในกระบวนการตัดและวิเคราะห์ DNA ด้วยความสามารถในการจำแนกและตัด DNA ในตำแหน่งเฉพาะ ทำให้เป็นเครื่องมือสำคัญในการโคลนยีน การสร้างแผนที่ยีน และการวิเคราะห์ลำดับเบสของ DNA นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการศึกษาการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมและการตรวจสอบความหลากหลายทางชีวภาพในระดับโมเลกุล การใช้งานเอนโดนิวคลีเอส SbfI ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความแม่นยำในงานวิจัยทางวิทยาศาสตร์ชีวภาพ