5-(and 6)-Carboxyrhodamine 110, mixed isomers ใช้อย่างแพร่หลายในการติดฉลากและการถ่ายภาพแบบเรืองแสง เป็นเครื่องมือสำคัญในงานวิจัยทางชีววิทยา ช่วยในการติดตามและแสดงภาพกระบวนการในเซลล์เนื่องจากมีเรืองแสงสีเขียวที่สว่างไสว ใช้บ่อยใน flow cytometry เพื่อช่วยในการคัดแยกและวิเคราะห์เซลล์ นอกจากนี้ยังใช้ในจุลทรรศน์แบบเรืองแสงเพื่อศึกษาเซลล์และเนื้อเยื่อที่ยังมีชีวิต สารนี้มีประสิทธิภาพในการย้อมสีกรดนิวคลีอิก ช่วยในการตรวจจับ DNA และ RNA ใน assays ต่างๆ นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวบ่งชี้ในงานศึกษากิจกรรมเอนไซม์ โดยเฉพาะใน assays ที่เกี่ยวข้องกับ proteases และ peptidases ความไวสูงและความเสถียรทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบสำหรับการใช้งานด้านการวินิจฉัยและการคัดกรองแบบ high-throughput