5(6)-ROX เป็นสารย้อมเรืองแสงที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในงานประยุกต์ทางชีววิทยาและเคมีต่างๆ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการติดฉลากและการตรวจจับเนื่องจากมีความแข็งแกร่งการเรืองแสงสูงและความเสถียร ในชีววิทยาโมเลกุล มักใช้ในเทคนิค fluorescence in situ hybridization (FISH) เพื่อแสดงภาพและทำแผนที่วัสดุทางพันธุกรรมในเซลล์ นอกจากนี้ ยังใช้เป็นตัวติดตามใน flow cytometry และ fluorescence microscopy ซึ่งช่วยให้นักวิจัยศึกษากายวิภาคและกระบวนการของเซลล์ด้วยความแม่นยำสูง สารย้อมนี้ยังถูกนำมาใช้ใน nucleic acid sequencing และ real-time PCR (polymerase chain reaction) ในฐานะโมเลกุล reporter เพื่อการตรวจจับลำดับเป้าหมายที่แม่นยำและอ่อนไหว ความเข้ากันได้กับช่วงความยาวคลื่นการกระตุ้นและการปล่อยทำให้เป็นเครื่องมือที่หลากหลายในงานวิจัยและการวินิจฉัย