5-Carboxyrhodamine 110 ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในด้านการวิจัยทางชีววิทยาและเคมี โดยเฉพาะในงานที่เกี่ยวข้องกับการติดตามและตรวจสอบกระบวนการทางชีวภาพ เนื่องจากมีคุณสมบัติเรืองแสงที่ชัดเจนและความไวสูง มักใช้เป็นสารสัญญาณ (probe) ในเทคนิคต่างๆ เช่น การทดสอบทางภูมิคุ้มกัน (immunoassays) การติดตามเซลล์ (cell tracking) และการวิเคราะห์ด้วยกล้องจุลทรรศน์แบบฟลูออเรสเซนต์ (fluorescence microscopy) นอกจากนี้ยังถูกใช้ในกระบวนการวิเคราะห์ทางชีวเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุลในเซลล์ รวมถึงการพัฒนาชุดทดสอบทางการแพทย์เพื่อวินิจฉัยโรค