เบนซิลซัลโฟนถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารตั้งต้นที่หลากหลาย มันมีบทบาทสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบและยาต้านจุลชีพ ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันทำให้เหมาะสมสำหรับการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนในการค้นพบยา นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเฉพาะทาง รวมถึงสีย้อมและโพลิเมอร์ ซึ่งกลุ่มซัลโฟนของมันช่วยเพิ่มคุณสมบัติของวัสดุ ในงานวิจัยทางเกษตรเคมี มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช การประยุกต์ใช้ของมันยังขยายไปสู่สาขาวิทยาศาสตร์วัสดุ ซึ่งใช้ในการสร้างโพลิเมอร์ขั้นสูงที่มีความต้านทานความร้อนและเคมีเฉพาะ