ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง (solid-phase peptide synthesis) โดยเฉพาะในกรณีที่ต้องการควบคุมการสร้างพันธะเปปไทด์อย่างแม่นยำ สารนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยป้องกันหมู่อะมิโนของอาร์จินีน ซึ่งช่วยป้องกันไม่ให้เกิดปฏิกิริยาข้างเคียงระหว่างการสังเคราะห์ โดยหมู่ Fmoc สามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน ขณะที่หมู่ sulfonyl ช่วยเพิ่มความเสถียรและลดการเกิดปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการ โดยเฉพาะในเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อนหรือไวต่อการสลายตัว นิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและพัฒนายาเปปไทด์ใหม่ๆ