ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาอนาล็อกฟลูออรีนของโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างไซโคลโพรเพนที่แข็งแรงรวมกับการแทนที่อะโรมาติกด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรภาพทางเมแทบอลิซึมและความเลือกในการจับ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับยาที่เล็งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลางและตัวยับยั้งคินาส หน้าที่ของอะมีนช่วยให้การดัดแปลงได้ง่าย สามารถนำเข้าไปในโครงสร้างโมเลกุลที่ใหญ่ขึ้นสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมบล็อกก่อสร้างฟลูออรีนสำหรับการพัฒนา PET tracer เนื่องจากมีอะตอมฟลูออรีนหลายตัวที่ช่วยในการถ่ายภาพ